生物屋さんのためのゼロからのプログラミング

―忘れないための覚書 (たま~に更新)―

2018-02-01から1ヶ月間の記事一覧

EclipseでImageJのPlugin作成 -2次元拡散方程式シミュレーション-

前回は、モンテカルロ法による分子拡散のシミュレーションを書いたので EclipseでImageJのPlugin作成 -拡散シミュレーション(ランダムウォーク)- - 生物屋さんのためのゼロからのプログラミング、今回は、2次元拡散方程式のシミュレーションを行ってみた。 …

EclipseでImageJのPlugin作成 -Time Stamper-

ImageJ(Fiji)には、"Time Stamper"というプラグインが内臓されているが、この"Time Stamper"を実行すると、 IJ.run(imp, "Time Stamper", "starting=0 interval=1 x=2 y=15 font=12 decimal=0 anti-aliased or=sec");のようになり、Javaなどで作成するプラグ…

EclipseでImageJのPlugin作成 -stack画像にROIを描き、その数値データをグラフ化する-

今回は、数値データをグラフ化するプラグインを書いた。コードは下記。 import java.awt.BorderLayout; import java.awt.Dimension; import java.awt.Graphics; import java.awt.Graphics2D; import java.awt.Toolkit; import java.awt.event.ActionEvent; i…

EclipseでImageJのPlugin作成 -拡散シミュレーション(ランダムウォーク)-

今回は粒子の拡散シミュレーションを行うImageJのPluginを書いてみた。コードは下記。 import java.awt.BorderLayout; import java.awt.FileDialog; import java.awt.Frame; import java.awt.event.ActionEvent; import java.awt.event.ActionListener; impo…

EclipseでImageJのPlugin作成 -数値から画像を作る-

今回は、数値から画像データを作る。但し、僕がざっくり調べた感じでは、何もない状態からでは数値から画像データを作れなかったので、 ここでは、既存の画像ファイルの数値を入れ替える方法で、数値から画像データを作ることにした。コードは下記。 import …