EclipseでImageJのPlugin作成 -下準備編- - 生物屋さんのためのゼロからのプログラミング

ImageJを活用した解析用ツールを開発することにした。
EclipseでImageJのいじれるようにするまでに少し苦労したので、備忘録を残す。（今回はMacを使用）
参考にしたのは、三浦耕太先生著の「ImageJではじめる生物画像解析」
ImageJではじめる生物画像解析 | 学研メディカル秀潤社の第５章−２ (p209-p212)

（注：これでうまくいかない場合は、この記事の次の記事
EclipseでImageJのPlugin作成 -下準備編 ver.2- - 生物屋さんのためのゼロからのプログラミング
を参照）

手順(1) Eclipseのダウンロード
EclipseはPleiades http://mergedoc.osdn.jp/からFull versionをダウンロードすれば簡単。しかもEclipseが日本語表記になる。

Macの場合は、ダウンロード終了後にフォルダーが現れるので、そのフォルダー内のEclipseのアイコンを同じくフォルダー内にあるApplicationのショートカットフォルダーにドラッグして入れば完了。

手順(2) ImageJのソースコードのコピー
GitHubのサイトhttps://github.com/dscho/minimal-ij1-pluginの”clone or download”からzipファイルをダウンロードし、
PCのDocumentsにminimal-ij1-pluginを移す。

手順(3) Eclipseにインポート
Eclipseを開いて、
”ファイル”→”インポート”→”Maven”→”既存Maveプロジェクト”
参照で上記で移したminimal-ij1-pluginを選択、現れるpom.xmlをチェックする。

Eclipseのパッケージ・エクスプローラーにインポートされたプロジェクトが現れるので、それを右クリック。
”リファクタリング”→”Maven アーティファクトの名前変更”

グループ ID: 任意の名前
アーティファクトID:作製するpluginの名称（どこかに”_”を必ず入れる）
バージョン: 作製中のものはSNAPSHOTと入れるらしい。
その下の『ワークスペースのEclipseプロジェクトの名前変更』にチェックを入れる。

これで、EclipseからImageJを動かせるはず。

うまくいっていれば、
”上記で名前を変えたプロジェクト”→”src/main/java”→”デフォルト・パッケージ”にある”Process_Pixels.java”を”Javaアプリケーション”で実行してみると、ImageJが立ち上がって、”Clown”の画像が開くはず。（その前に”Process pixels”という入力画面が現れるが）